Dù là phe nổi dậy, đối đầu với quân đội Chính phủ nhưng đại diện của FSA khẳng định không liên quan đến một loạt vụ nổ tại căn cứ được cho là có kho chứa tên lửa chống hạm đáng sợ nhất thế giới P-800 Yakhont của Chính phủ Syria. “Cuộc tấn công này không phải do quân nổi dậy thực hiện. Đó là một cuộc không kích bằng tên lửa từ máy bay chiến đấu hay từ tàu chiến ở ngoài Địa Trung Hải”.
Phe nổi dậy Syria cho rằng họ có đủ vũ khí để phá hủy căn cứ hải quân nhưng FSA không có động cơ để làm điều đó. Và họ cho rằng rất có thể quân đội Israel đã gây ra vụ nổ.
Tuy nhiên, Israel không phủ nhận hay thừa nhận các vụ nổ tại căn cứ hải quân Safir có liên quan đến họ. Khi được hỏi về vụ nổ xảy ra tại căn cứ Hải quân Syria, Bộ trưởng Quốc phòng Israel Moshe Ya'alon cho rằng: “Ở Trung Đông khi nói đến một cuộc tấn công không rõ nguyên nhân người ta luôn tìm cách để đổ lỗi cho chúng tôi”.
Trước đó, Israel đã bày tỏ lo ngại về kho vũ khí hiện đại của quân đội Chính phủ Syria trong đó có sát thủ chống hạm P-800 Yakhont có thể được chuyển giao cho phiến quân ở Lebanon, lực lượng phiến quân Hezbollah. Nếu có Yakhont, Hezbollah sẽ có thể tấn công hạm đội Israel và đe dọa các dàn khoan dầu ngoài khơi của nước này.
P-800 Yakhon trang bị động cơ phản lực tĩnh dòng thẳng siêu âm cho phép đạt tốc độ gấp hơn 2 lần vận tốc âm thanh. Với vận tốc cực lớn như vậy, đối phương rất khó phản ứng kịp thời và bị tiêu diệt bởi đầu đạn thuốc nổ phân mảnh nặng 200-250 kg. Theo đánh giá của chuyên gia thế giới, với đầu đạn đó P-800 Yakhon có khả năng tiêu diệt tàu chiến cỡ lớn chỉ bằng một phát bắn duy nhất.