Thời điểm trên, tàu hỏa mang số hiệu NH1, do lái tàu Nguyễn Đình Sáng điều khiển lưu hành theo hướng bắc-nam, đến km 1201+800, ngã tư giao nhau với đường sắt thuộc phường Phú Thạnh, đã tông trực diện vào xe ô-tô 12 chỗ ngồi, hiệu TOYOTA.
Sau cú va chạm mạnh, tàu hỏa kéo lê xe ô-tô khoảng 200m mới dừng hẳn. Hậu quả, ô-tô bốc cháy dữ dội, hư hỏng hoàn toàn. Đầu máy tàu bị cháy xém, vỡ gương chắn gió ở buồng lái và hư đèn Cos.
Lực lượng cứu hộ và Công an Phú Yên phải huy động xe cứu hỏa, ô-tô tải kéo xe ô-tô bị nạn ra khỏi đường sắt và thông tuyến chạy tàu lúc 5 giờ 29 phút.
Tại hiện trường cho thấy, phía sau xe-ô tô mang biển số 68H-2608, nhưng thân lại mang biển số 70B-0505 kèm theo dòng chữ: "Công ty TNHH Nhà nước Xổ số kiến thiết tỉnh Tây Ninh tặng Bệnh viện Đa khoa Tây Ninh".
Thời điểm xảy ra tai nạn, người dân phát hiện trên xe không có người.
Vụ việc đang được các cơ quan chức năng của tỉnh Phú Yên điều tra làm rõ.