Với chức trách Giám đốc Trung tâm ĐKPT GTVT Phú Yên, trong 2 năm (2015-2016), ông Nguyễn Ngọc Thành đã cùng các cộng sự tự “vẽ” ra nhiều khoản phụ cấp tăng thu nhập cho cán bộ - nhân viên, lạm chi công quỹ trái pháp luật gần 715 triệu đồng; để cho 3 nữ nhân viên thu tiền phí kiểm định 259 xe ô tô thập hơn mức phí quy định, gây thất thoát ngân sách hơn 54 triệu đồng;
Không chỉ đạo bộ phận chuyên môn hạch toán sổ sách tài chính kế toán hơn 731 triệu đồng tiền hoa hồng bán bảo hiểm xe ô tô do các doanh nghiệp bảo hiểm trích lại trong 4 năm (2013-2016), mà tự “chia phần” cho các cán bộ - nhân viên; thiếu trách nhiệm trong công tác quản lý để cho hai nhân viên Nguyễn Thị Thanh Tâm, Nguyễn Nữ Trà My trục lợi cá nhân 34 triệu đồng hoa hồng bán bảo hiểm xe ô tô.
Trước đó vào ngày 9-5, Giám đốc Trung tâm ĐKPT GTVT Phú Yên cùng đã ban hành quyết định xử lý kỷ luật bằng hình thức cảnh cáo đối với hai nhân viên Nguyễn Thị Thanh Tâm, Nguyễn Nữ Trà My, buộc hoàn trả lại số tiền 34 triệu đồng hoa hồng bán bảo hiểm đã trục lợi cá nhân.
Trong kết luận thanh tra của Thanh tra tỉnh Phú Yên và Thanh tra Sở GTVT Phú Yên cũng đã yêu cầu Trung tâm ĐKPT GTVT Phú Yên phải thu hồi số tiền lạm chi trái pháp luật gận 715 triệu đồng, nộp bổ sung thuế thu nhập 39 triệu đồng, truy thu nộp vào ngân sách hơn 54 triệu đồng phí kiểm định bị thất thoát…