Theo đó khu vực quy hoạch có diện tích 16,7ha, với giới hạn cụ thể: Phía Đông Bắc giáp hành lang bảo vệ Rạch Thị Nghè, phía Đông Nam giáp đường Nguyễn Hữu Cảnh, phía Tây Nam giáp đường Nguyễn Bỉnh Khiêm, phía Tây Bắc giáp đường Nguyễn Thị Minh Khai.
Các khu chức năng chính bao gồm công viên cây xanh, chuồng trại, hành chính, phụ trợ, dịch vụ (giáo dục, thương mại - dịch vụ, văn hóa, giải trí).
Cụ thể, chủ đầu tư cho biết sẽ giữ lại toàn bộ hệ thống cây lớn hiện trạng, và trồng thêm hệ thống cây bụi (tre, trúc) dọc theo các trục đường hoặc vị trí tiếp giáp giữa khu chuồng thú với các khu vực phát sinh tiếng ồn nhằm giảm thiểu tối đa tiếng ồn làm ảnh hưởng đến môi trường sống của các loài thú.
Trong khi đó các khu vực chuồng thú hiện trạng sẽ phân loại theo môi trường sống và lớp động vật để phân thành từng khu vực lớn, bao gồm: Khu gấu; Khu thú họ mèo: cọp trắng; Khu voi, bò, trâu; Khu vườn thú thiếu nhi với các loài thú thân thiện như: heo, gà, dê, ngựa, trâu nước…, các khu vực nhà kiếng, vườn thực vật…
Ngoài ra còn có khu thú Châu Phi như: Hươu cao cổ, Đà điểu, Ngựa vằn, Dê rừng, Tê giác, Hà mã, Hắc tinh tinh, Chó hoang Châu Phi, Sư tử, Chim cánh cụt Châu Phi…
Khu thú ban đêm, bao gồm các loài: Mèo vàng, Mèo rừng, Báo gấm, Cầy hương, Cầy Ấn Độ, Tê tê… Khu thú móng guốc: Nai, Hươu sao, Hươu sừng tấm, Linh dương đầu bò…
Đặc biệt tại đây còn có một bãi đậu xe với với 2 loại hình là mặt đất và ngầm.
Theo đó bãi xe mặt đất là nơi đậu của xe buýt và xe khách của các đoàn đến tham quan, xe ôtô của khách, xe của nhân viên Thảo Cầm Viên Sài Gòn.
Nhà xe sẽ có quy mô 2 tầng, được bố trí phía đường Nguyễn Thị Minh Khai tại khu vực cổng phụ Nguyễn Bỉnh Khiêm.
Về bãi xe ngầm, TP cho biết đã chấp thuận chủ trương xây dựng bãi xe ngầm tại trục đường Nguyễn Thị Minh Khai và đường Nguyễn Bỉnh Khiêm theo ý kiến của Sở Giao thông vận tải.
Bãi xe này có quy mô 1ha, phục vụ cho khoảng 3.000 xe máy và 100 ô tô.
Với công trình này TP yêu cầu phần hầm ngầm phía dưới các khu chuồng thú phải có giải pháp thi công đồng bộ, có giải pháp chống tiếng ồn để tránh làm ảnh hưởng đến các loại thú phía trên.