Theo Tân Hoa xã, hơn 1,2 triệu người ở Hải Nam, Quảng Đông và khu tự trị dân tộc Choang Quảng Tây đã bị ảnh hưởng bởi cơn bão. Tình trạng mất điện trên diện rộng và gián đoạn dịch vụ viễn thông cũng được ghi nhận.
Ngày 6/9, sau khi quét qua Hồng Kông, siêu bão Yagi đã đổ bộ vào Trung Quốc 2 lần – lần đầu tiên là vào đảo Hải Nam và sau đó là tỉnh Quảng Đông. Đêm 6/9, Yagi đã vượt qua eo biển Quỳnh Châu ở phía Bắc Hải Nam và đổ bộ lần thứ hai vào Quảng Đông với sức gió hơn 200 km/giờ. Tại Quảng Đông, hơn 574.500 người được sơ tán khỏi khu vực có nguy cơ cao từ trưa 6/9.
Chỉ khoảng 1 giờ sau khi đổ bộ, siêu bão Yagi khiến khu vực Hải Nam mất điện diện rộng, ảnh hưởng đến 830.000 hộ gia đình trong tỉnh.
Chủ tịch Tập Cận Bình đã chỉ thị cho các quan chức địa phương nhanh chóng xác minh thương vong và thiệt hại cũng như tổ chức các nỗ lực cứu trợ thiên tai, sửa chữa cơ sở hạ tầng bị hư hại và sớm khôi phục cuộc sống bình thường. Khoảng 200 triệu nhân dân tệ (28,2 triệu đô la Mỹ) đã được phân bổ cho hoạt động cứu trợ thiên tai, tập trung vào sửa chữa đường sá, cầu cống và đập cũng như khôi phục trường học, bệnh viện và các cơ sở công cộng khác.
Cục Khí tượng Trung Quốc đã ban hành cảnh báo về lượng mưa lớn, lũ lụt và nguy cơ lở đất gia tăng. Một đợt triều cường có sức tàn phá cũng dự kiến sẽ xảy ra dọc theo bờ biển phía bắc của Hải Nam và bờ biển phía nam của Bán đảo Lôi Châu.
Sức tàn phá của cơn bão đã tăng gấp đôi kể từ khi nó tàn phá Philippines vào đầu tuần này. Trước đó, bão Yagi đã khiến ít nhất 13 người thiệt mạng ở Philippines.