Theo dự thảo, cá nhân, tổ chức đưa vào Việt Nam những loài ngoại lai có nguy cơ xâm hại, lưu giữ, nuôi trồng, làm lây lan phát triển hoặc phóng sinh loài ngoại lai có nguy cơ xâm hại sẽ bị phạt từ 40 đến 100 triệu đồng, đồng thời phải tiêu hủy, đưa ra khỏi lãnh thổ.
Cơ quan hữu trách cũng sẽ xử phạt với số tiền tối đa là 100 triệu đồng đối với một trong các hành vi vi phạm như đưa vào lãnh thổ Việt Nam dịch hại thuộc diện điều chỉnh của Việt Nam hoặc sinh vật gây hại lạ còn sống mà chưa được phép của Bộ trưởng Bộ NN-PTNT, đưa đất có sinh vật gây hại vào Việt Nam, không thực hiện tái xuất vật thể kiểm dịch bị nhiễm dịch hại kiểm dịch thực vật đúng thời hạn theo quyết định của cơ quan kiểm dịch thực vật.
Dự thảo nghị định cũng đưa ra các mức phạt tiền cụ thể đối với các hành vi vi phạm liên quan đến việc sản xuất, buôn bán và sử dụng thuốc bảo vệ thực vật, khảo nghiệm và sử dụng giống cây trồng... với số tiền phạt cao hơn quy định hiện hành.
