Theo đó, mức thu quy định tại Thông tư 274/2016/TT-BTC và các văn bản hướng hướng dẫn liên quan được thống nhất hiểu như sau:
- Phí hải quan đăng ký tờ khai: 20.000 đồng/tờ khai đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu (bao gồm cả hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu là phương tiện vận tải đường biển, đường sông, đường sắt, đường bộ).
- Phí hải quan kiểm tra, giám sát hoặc tạm dừng làm thủ tục hải quan đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu có yêu cầu bảo hộ quyền sở hữu trí tuệ: 200.000 đồng/01 đơn.
- Phí hải quan: 50 USD/ chuyến bay đến đối với chuyến bay của nước ngoài đến các cảng hàng không Việt Nam.
- Lệ phí đối với phương tiện quá cảnh đường bộ: 200.000 đồng/phương tiện
- Lệ phí đối với phương tiện quá cảnh đường thủy: 500.000 đồng/phương tiện.
Ngoài ra, Công văn 797/TCHQ-TXNK còn hướng dẫn hạch toán các khoản thi ngân sách đối với các khoản phí, lệ phí nộp vào ngân sách nhà nước.