Khủng long đã trải qua hai lần tuyệt chủng vào hai thời kì khác nhau. Lần đầu tiên cách đây 200 triệu năm, cuộc đại tuyệt chủng này được gọi là Trias-Jura, đã khiến rất nhiều loại khủng long trên cạn bị tuyệt chủng, ngay cả những loại bạo chúa. Lần tuyệt chủng thứ hai là cách đây 66 triệu năm, đã quét sạch đi hơn 70% các loại sinh vật trên Trái Đất.