Cục Cảnh sát phòng chống tham nhũng – Bộ Công an đã ra quyết định khởi tố bị can về tội danh lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ (theo Điều 281 - BLSH), và áp dụng biện pháp ngăn chặn đối với ông Đỗ Quốc Khánh - nguyên TGĐ Tổng Công ty CP Vận tải dầu khí Việt Nam; ông Bùi Văn Viện - nguyên Phó TGĐ Tổng Công ty CP Vận tải dầu khí Việt Nam; và ông Phạm Văn Đoàn - Giám đốc Công ty TNHH Hợp Thủy.
Được biết, Tổng Công ty CP Vận tải dầu khí Việt Nam là đơn vị thuộc Tổng Công ty Hàng hải Việt Nam.
Động thái tố tụng trên là diễn tiến điều tra mở rộng vụ án tham ô tài sản, xảy ra tại Xí nghiệp sửa chữa tàu biển Falcon (nay là Công ty CP Vận tải dầu khí Việt Nam), thuộc Tổng Công ty CP Vận tải dầu khí Việt Nam.
Ngày 16-10-2012, CQĐT Bộ Công an đã khởi tố, bắt tạm giam Nguyễn Thế Ngọc, 37 tuổi - nguyên kế toán trưởng của doanh nghiệp này.
Tháng 9-2006, Xí nghiệp sửa chữa tàu biển Falcon ký hợp đồng sửa chữa một chiếc sà lan 5.000 tấn, trị giá hợp đồng hơn 3,6 tỷ đồng. Quá trình sửa chữa, đơn vị này đã bổ sung dự toán thêm hơn 2 tỷ đồng.
Tháng 3-2007, đơn vị sửa chữa đã nghiệm thu và đến tháng 10-2007, Falcon đã quyết toán, thanh lý hợp đồng. Theo tài liệu điều tra của cơ quan chức năng, các bị can trên đã lập khống hồ sơ tài liệu để chiếm đoạt hàng tỷ đồng của Nhà nước.