Sau hơn 3 tháng điều tra, ngày 13/1, cơ quan cảnh sát điều tra Công an TP Hà Nội đã ra kết luận dài 8 trang, đề nghị truy tố Nguyễn Mạnh Tường các tội danh Vi phạm quy định khám bệnh, chữa bệnh, sản xuất pha chế thuốc, cấp phát thuốc hoặc dịch vụ y tế khác và Xâm phạm thi thể. Bị can Đào Quang Khánh (18 tuổi) bị đề nghị tội danh Xâm phạm thi thể, mồ mả, hài cốt và Trộm cắp tài sản.
Sáng 14/1, trước sự chứng kiến của luật sư Nguyễn Anh Thơm, người được chỉ định bảo vệ quyền và lợi ích cho Khánh, cơ quan công an đã tống đạt bản kết luận điều tra.
Theo cơ quan điều tra, bị can Tường được xác định là người trực tiếp gây ra cái chết cho chị Lê Thị Thanh Huyền trong quá trình phẫu thuật thẩm mỹ hút mỡ bụng, bơm ngực tại trung tâm thẩm mỹ Cát Tường vào chiều 18/9/2013. Sau khi biết chị Huyền tử vong, Tường đã chỉ đạo nhân viên thu dọn đồ đạc tại phòng khám mang đi cất giấu. Thấy mọi người dọn dẹp đồ đạc, Khánh đã vào phòng chị Huyền đang nằm lấy trộm chiếc điện thoại Iphone 5.
Khoảng 23h cùng ngày, Tường cùng một số nhân viên đưa thi thể chị Huyền lên xe ô tô đưa đến Bệnh viện Bưu điện. Do thấy đông người, xác chị Huyền đã co cứng nên Tường nảy sinh ý định ném thi thể nạn nhân xuống sông. Bảo vệ Khánh đi chiếc xe máy của chị Huyền theo sau ô tô. Tời giữa cầu Vĩnh Tuy, do còn đông người qua lại, Tường tiếp tục đi đến đường Cổ Linh, quận Long Biên rồi dừng lại. Khánh bỏ lại chiếc xe máy cùng túi xách của nạn nhân rồi lên ô tô cùng với Tường lên cầu Thanh Trì. Đến giữa cầu, Tường cùng Khánh khênh xác nạn nhân đẩy xuống sông Hồng rồi về nhà.
Đến nay, sau gần 4 tháng tìm kiếm, gia đình chị Huyền vẫn chưa tìm thấy xác nạn nhân. Gia đình bị can Tường đã tự nguyện bồi thường cho đại diện người bị hại 150 triệu đồng.
Theo đề nghị truy tố, khung hình phạt mà bác sĩ Tường đối diện cao nhất cho cả hai tội danh là 22 năm tù, Khánh đối diện 8 năm tù với hai tội danh.