Sau khi xem xét báo cáo của Sở Nội vụ và giải trình của tập thể, cá nhân liên quan việc tổ chức đoàn đi công tác Nhật Bản sử dụng kinh phí ngân sách của Sở Giáo dục và Đào tạo, UBND TP.HCM quyết định "phê bình nghiêm khắc" ông Lê Hồng Sơn (Giám đốc Sở Giáo dục và Đào tạo) cùng 2 phó giám đốc sở là ông Nguyễn Văn Hiếu và ông Lê Hoài Nam vì đã để xảy ra các sai phạm, thiếu sót.
UBND TP yêu cầu ông Sơn cần nhận thức sâu sắc trước những thiếu sót cá nhân và sai sót của cấp dưới có liên quan đến ngành, lĩnh vực phụ trách.
Trước đó, Sở Giáo dục và Đào tạo đã ký hợp đồng với Công ty cổ phần Tiến Bộ Quốc tế tổ chức chuyến đi học bồi dưỡng quản lý ngành học mầm non tại Nhật Bản, có chi phí phụ cấp tiền tiêu vặt lên đến 46,4 triệu đồng "không đúng quy định".
Thanh tra TP.HCM còn chỉ ra một loạt sai phạm của Sở Giáo dục và Đào tạo như duyệt chi phí tổ chức khóa đào tạo giảng viên dạy Toán, Khoa học bằng tiếng Anh với số tiền 36 tỷ đồng chưa phù hợp.
Sở Giáo dục và Đào tạo đã không trình UBND thành phố xem xét quyết định về giá dịch vụ đào tạo theo đề nghị của Sở Tài chính; chưa xác định trên thực tế; không có quyết định đầu tư được phê duyệt; kế hoạch lựa chọn nhà thầu chưa chặt chẽ trong việc chọn hình thức chỉ định thầu theo quy định.
Thanh tra Thành phố cũng nêu ra một loạt sai phạm khác của Sở Giáo dục và Đào tạo liên quan đến quản lý tài chính, ngân sách trong ngành giáo dục, đào tạo và quản lý nhà, đất...