Các dự án này gồm:
1. Đảo Hòn Lớn
2. Khu vực núi Khải Lương
3. Khu phi thuế quan
4. Cảng trung chuyển quốc tế Vân Phong
5. Khu đô thị sinh thái Mũi Đá Son
6. Khu du lịch, sinh thái và đô thị Tuần Lễ - Hòn Ngang
7. Cụm đảo Điệp Sơn
8. Khu đô thị Cổ Mã - Tu Bôn
9. Khu công nghiệp Vạn Thắng
10. Khu công nghiệp Dốc Đá Trắng
11. Khu đô thị Đông Bắc Ninh Hòa
12. Khu chức năng công nghiệp Ninh Hải
13. Tổ hợp lọc hóa dầu
14. Nhà máy điện Vân Phong 2
15. Khu phát triển công nghiệp Ninh Tịnh
16. Khu đô thị Ninh Đa…
Ngoài ra, Ban Quản lý cũng nhận được đề xuất của các nhà đầu tư về lập quy hoạch 5 khu công nghiệp mới trên địa bàn tỉnh gồm:
17. Khu công nghiệp Vạn Lương
18. Khu công nghiệp Xuân Sơn
19. Khu công nghiệp Ninh Sơn
20. Khu công nghiệp Ninh Xuân
21. Khu công nghiệp Diên Thọ.
Trong số các dự án trên, Thường trực Tỉnh ủy Khánh Hòa cho phép Ban Quản lý KKT Vân Phong lập quy hoạch phân khu 1/2000 đối với 3 khu vực chức năng gồm:
1. Khu đô thị, dịch vụ và du lịch Tuần Lễ - Hòn Ngang
2. Khu du lịch đảo Điệp Sơn
3. Khu đô thị Cổ Mã - Tu Bông
Song song với lập quy hoạch chung, Thường trực Tỉnh ủy cũng cho phép Ban Quản lý xem xét các đề xuất phân khu đầu tư của các nhà đầu tư chiến lược.
Ông Nguyễn Hải Ninh - Bí thư tỉnh Khánh Hòa yêu cầu UBND tỉnh xem xét, chỉ đạo Ban Quản lý KKT Vân Phong phối hợp với các sở, ngành liên quan tiếp nhận tất cả ý tưởng góp ý của các nhà đầu tư; sau đó, xem xét, lựa chọn các nhà đầu tư vào KKT Vân Phong đảm bảo tính công khai, đúng trình tự thủ tục.
Tuy nhiên, trước khi xem xét các đề xuất đầu tư cần có một quy hoạch tổng thể; sau đó, tỉnh sẽ kêu gọi đầu tư theo đúng quy hoạch đã chọn. Đối với quy hoạch khu công nghiệp mới, Bí thư Tỉnh uỷ đề nghị các sở, ngành, địa phương liên quan phối hợp với Ban Quản lý KKT Vân Phong nghiên cứu và xem xét để sớm bổ sung vào quy hoạch chung...