Theo cáo trạng truy tố, vào khoảng 21 giờ 30 phút, ngày 15/8/2016 chị Từ Thị N đi bộ từ hướng xã Ninh Hòa về TT. Ngan Dừa để về nhà.
Khi đến bến đò ông Thiện (thuộc ấp Kinh Xáng, xã Lộc Ninh, huyện Hồng Dân, tỉnh Bạc Liêu) thì gặp Huynh đang chờ để qua đò.
Do giữa Huynh và chị N là chỗ quen biết, Huynh gọi chị N là cô họ nên Huynh không qua đò mà kêu chị N lên xe chở về nhà.
Trên đường về, Huynh nảy sinh ý định quan hệ tình dục với chị N nên đã chở chị N đến nhà trọ Ngọc Hân (thuộc ấp Kinh Xáng, xã Lộc Ninh, huyện Hồng Dân, tỉnh Bạc Liêu).
Sau đó, Huynh đưa chị N vào phòng trọ số 5 khóa cửa lại rồi thực hiện hành vi đồi bại với chị N. Sau khi quan hệ xong chị N ra về. Đến ngày 16/8/2016, chị N đến cơ quan chức năng trình báo vụ việc.
Tại phiên phúc thẩm, nhận thấy hành vi của bị cáo nguy hiểm cho xã hội, bản thân bị cáo trước khi phạm tội từng giữ chức vụ Phó chỉ huy Quân sự TT. Ngan Dừa, huyện Hồng Dân, tỉnh Bạc Liêu, đồng thời bị cáo không đưa ra được tình tiết giảm nhẹ nên HĐXX đã tuyên bị cáo Nguyễn Hoàng Huynh y án sơ thẩm 2 năm tù về tội Hiếp dâm.
Về dân sự, buộc bị cáo Huynh phải có trách nhiệm bồi thường cho bị hại 29,2 triệu đồng.