Thay vì nâng cấp từ S-400, S-500 là một phiên bản đặc biệt chuyên dùng để đánh chặn các tên lửa đạn đạo tầm xa, nó có thể đánh chặn một mục tiêu đang bay cao 200 km.
S-500 có khả năng ngăn chặn các phương tiện bay siêu thanh kiểu mới như Waverider (Mỹ đang thử nghiệm), bắn hạ vệ tinh đối phương hoặc các loại vũ khí triển khai ở quỹ đạo thấp.
S-500 sẽ được sử dụng để ngăn chặn các mục tiêu trên không, tên lửa phòng thủ bảo vệ các địa điểm chiến lược, khu vực địa lý rộng, cơ sở công nghiệp quan trọng...
Liên quan tới quá trình phát triển S-500, cuối tháng 2.2014, Lãnh đạo Ủy ban Phòng không - Vũ trụ Nga ông Igor Ashurbeyli cho biết, Nga đang phát triển và hoàn thiện đạn tên lửa đánh chặn dành cho tổ hợp S-500.
Theo các thông tin sơ bộ, S-500 có khả năng khai hỏa cùng lúc vào 10 mục tiêu trên không, trong đó có cả mục tiêu là tên lửa hành trình siêu thanh có tốc độ bay đạt 7 km/giây.
Tổ hợp tên lửa phòng không mới của Nga được trang bị hệ thống ra-đa cảnh giới công suất cực mạnh có thể phát hiện ra mục tiêu ở khoảng cách 800 - 900 km.
Nhiều khả năng, S-500 sẽ là một thành phần của hệ thống lá chắn tên lửa phòng thủ Moscow, gồm A-135 Amur và tương lai là A-235 Samaliot-M.
Bộ Quốc phòng Nga dự kiến sẽ biên chế 10 tiểu đoàn S-500. Mỗi hệ thống S-500 được cấu thành từ các đơn nguyên riêng rẽ: radar cảnh giới tầm xa, ra đa dẫn bắn, xe điều khiển trung tâm, các xe chở, nạp đạn…
Tổ hợp tên lửa phòng không tiên tiến này sẽ triển khai trên các xe di động, với các bệ phóng đặt trên xe vận tải hạng nặng bánh lốp 10 x 10.
Phương pháp tổ chức này dựa trên cơ sở chiến thuật “trang bị phân tán, hỏa lực tập trung”, trong tác chiến nếu một đơn nguyên nào bị thiệt hại thì sẽ nhanh chóng được bổ sung, thay thế, khôi phục ngay lập tức sức mạnh chiến đấu của cả tổ hợp.