Kết quả điều tra ban đầu xác định, vào ngày 12-1-2015, Sở Tài nguyên và Môi trường (TN&MT) tỉnh Bến Tre cấp Giấy chứng nhận đủ điều kiện nhập khẩu phế liệu số 69/CN-STNMT cho Công ty Hồng Việt trong khi Công ty Hồng Việt không có nhà xưởng, máy móc, dây chuyền sản xuất, tái chế phế liệu theo quy định của pháp luật.
Từ tháng 11-2015 đến tháng 2-2017, Công ty Hồng Việt đã lợi dụng Giấy chứng nhận đủ điều kiện nhập khẩu phế liệu và 76 Thông báo lô hàng phế liệu nhập khẩu do Sở TN&MT tỉnh Bến Tre cấp để nhập khẩu trái phép khoảng hơn 5.000 container phế liệu vào Việt Nam.
Vào ngày 3-11 vừa qua, Cơ quan CSĐT Bộ Công an đã ra quyết định khởi tố bị can số 188,189/C03-P15 và Lệnh bắt tạm giam đối với 2 bị can gồm Đoàn Văn Phúc, nguyên Phó Giám đốc Sở TN&MT tỉnh Bến Tre (hiện nay là Phó Chủ tịch Hội Nông dân tỉnh Bến Tre) và Trương Văn Em, Chi cục Trưởng Chi cục bảo vệ môi trường Bến Tre về tội “Lợi dụng chức vụ, quyền hạn trong khi thi hành công vụ” theo Điều 356 Bộ luật Hình sự năm 2015; và khám xét nơi ở, nơi làm việc các đối tượng nêu trên.
Các quyết định và lệnh trên đã được Viện kiểm sát nhân dân tối cao phê chuẩn.
Hiện nay, Cơ quan CSĐT Bộ Công an đang tập trung lực lượng điều tra làm rõ, mở rộng triệt để các tổ chức, cá nhân liên quan đến vụ án để thu hồi tài sản, xử lý nghiêm trước pháp luật.