HLV Hoàng Anh Tuấn từng giúp bóng đá Việt Nam làm nên kỳ tích giành vé tham dự U20 World Cup 2017 với lứa cầu thủ tài năng Nguyễn Quang Hải, Trần Đình Trọng, Đoàn Văn Hậu, Hà Đức Chinh, Nguyễn Hoàng Đức, Hồ Tấn Tài, Huỳnh Tấn Sinh…
Tuy nhiên, HLV Hoàng Anh Tuấn đã đệ đơn xin từ chức và được VFF đồng ý sau khi U18 Việt Nam thua sốc U18 Campuchia ngay trên sân nhà và bị loại ngay từ vòng bảng giải U18 Đông Nam Á hồi tháng 8/2019.
Sau hơn 1 năm vắng bóng trong làng bóng đá Việt Nam, HLV Hoàng Anh Tuấn đã tái xuất khi nhận đảm nhận vai trò giám đốc kỹ thuật cho CLB Phù Đổng, đội bóng mới giành vé lên chơi tại giải hạng Nhất 2021.
Theo thông cáo từ CLB Phù Đổng, HLV Hoàng Anh Tuấn sẽ hoạch định chiến lược phát triển, tham mưu và chịu trách nhiệm về chuyên môn cũng như kết quả đào tạo và thành tích của đội bóng. Ngoài ra, ông Hoàng Anh Tuấn cũng thành viên thuộc Hội đồng quản trị CTCP Đầu tư Thể thao Phù Đổng.
Ở cấp độ CLB, HLV Hoàng Anh Tuấn từng dẫn dắt Khánh Hòa (2007-2012) và Hải Phòng (2013-2014) chinh chiến tại V-League./.